Esta obra fue concebida por su autor como la segunda parte de los Comentarios reales. Garcilaso no pudo ver publicada su obra pues murió en 1616, a la de edad de 77 años. Al año siguiente salió a la venta el libro, bajo el título de Historia general del Perú, nombre que arbitrariamente le impuso el editor, que consideró nada llamativo el título original.En ella se abarca un crucial período de la historia del Perú, que empieza con la llegada de los españoles y termina con la ejecución pública del último inca, Túpac Amaru, ocurrida en 1572. Incluye en sus páginas una rehabilitación de su padre, el capitán Sebastián Garcilaso de la Vega, desprestigiado ante la Corona por haber militado en el bando del rebelde Gonzalo Pizarro.